L’Institut National de Technologie Agricole réussi à séquencer le génome de la cicadelle du maïsaprès le désastre agronomique provoqué par la peste comme vecteur de Spiroplasma et du complexe Achaparramiento et en vue du cycle de semis 2024/25.
Selon le gouvernement national, il s’agit d’un une étape scientifique qui nous permettra de comprendre la biologie de l’insecte, de concevoir des stratégies de lutte contre les insectes plus efficaces et de faciliter le développement de variétés de maïs plus résistantes aux maladies transmises par ce ravageur.
Le travail a été réalisée par une équipe de spécialistes du Centre de Recherche Agronomique INTA de Cordoueune agence du Secrétariat de la Bioéconomie dépendant du Ministère de l’Économie de la Nation.
Stratégies et contrôle
La cicadelle est le vecteur de quatre pathogènes : deux mollicutes -bactéries- (Spiroplasma kunkelii et Maize bushy stunt phytoplasma) et deux virus (Maize striped fine virus et Maize striate mosaïque virus), qui peuvent être trouvés dans des infections simples ou mixtes et génèrent le maladie.
A l’IPAVE, tous ces pathogènes sont historiquement étudiés et Le séquençage, l’assemblage et l’annotation du génome de Dalbulus maidis réalisés par les chercheurs de l’INTA constituent la première avancée mondiale enregistrée à ce jour..
Cette étape scientifique a été franchie après avoir détecté que les conditions de températures élevées et de précipitations abondantes, ainsi que l’étalement des dates de semis, étaient les principales causes de la reproduction rapide et de la migration du ravageur du nord du pays vers la zone de production. cœur.
Outre l’impact sur la lutte contre la cicadelle du maïs, Cette recherche fournira des informations permettant de comprendre la biologie, la répartition et l’évolution de l’insecte, ce qui aidera à prédire et à atténuer les futures épidémies..
En outre, “cela permettra de développer des approches plus précises et ciblées pour lutter contre ce ravageur, à travers la réduction de l’utilisation de produits phytosanitaires”, a commenté l’organisme technique gouvernemental.
Aussi, pourrait être utilisé dans l’amélioration génétique du maïsfacilitant le développement de variétés plus résistantes aux maladies transmises par cet insecte.
En ce sens, « nous pourrions comprendre des aspects tels que les gènes de l’immunité des insectes, identifier des cibles potentielles pour le développement de meilleurs insecticides, ainsi que les gènes associés à leur interaction avec les plantes infectées et les agents pathogènes », ont-ils expliqué.
Comment l’ADN a été séquencé
Tout d’abord, il convient d’expliquer que Le génome est la séquence totale d’ADN d’un organisme particulier.. Le séquençage d’un génome consiste à pouvoir déterminer l’ordre exact des bases adénine, cytosine, guanine et thymine (A, C, G et T) dans l’ADN.
Dans le cas particulier de la Cicharrita, 20 spécimens ont été traités, obtenus à partir d’une colonie saine propagée en serre.. Une colonie expérimentale de ces insectes est maintenue à l’Institut de Pathologie Végétale INTA avec un état sanitaire contrôlé.
Dans cette organisation, María de la Paz Giménez Pecci, référence dans l’étude des maladies du maïs, avec Mariana Ferrer et Karina Torrico, travaillent sur l’étude du pathosystème, son comportement et son évolution au fil des années.
« Leur contribution ne s’est pas limitée à la possibilité de compter les insectes élevés dans notre institut pour ce projet, mais leur expérience et leurs connaissances en tant que références en pathologie des cultures ont été essentielles dans cette urgence », a souligné Franco Fernández, biologiste et coordinateur du nœud. de séquençage génomique au CIAP de Cordoue.
Précisément, Pour extraire l’ADN de l’insecte, ils ont utilisé des techniques de biologie moléculaire, puis a été construite « la bibliothèque », qui est comme un premier réservoir d’informations génétiques et qui sert au traitement des données.. Pour le séquençage, ils ont utilisé une stratégie hybride, qui combine la plateforme ONT (Oxford Nanopore Technologies) pour les lectures longues et Illumina pour les lectures courtes.
“Grâce au séquençage en temps réel avec ONT, nous avons pu obtenir une première ébauche de l’ADN en 48 heures, ce qui représente une étape scientifique en un temps record”, a déclaré Fernández.
L’étape suivante était l’assemblage du génome, puis les fragments étaient séquencés et l’étape suivante consistait à les intégrer pour reconstruire le génome de l’insecte..
« Tout ce travail a été possible grâce au fait qu’au fil des années, Au CIAP, le nœud de séquençage a été consolidé, qui dispose actuellement d’appareils de pointe et des serveurs bioinformatiques de grande capacité et grâce à des ressources stratégiques destinées à faire face à une urgence sanitaire sans précédent », a conclu Fernández.
*Source : INTA
